Les soustractions s'effectuent de la même manière que les additions avec simplement une étape supplémentaire :

1. Inscrire le premier terme sur le dispositif d'entrée.

2. Effectuer un tour complet de manivelle.

3. Inscrire le second terme sur le dispositif d'entrée.

4. Mettre la manivelle en position haute.

5. Effectuer un second tour de manivelle.

Voici, par exemple, le calcul de 156 − 79 :

Étape 1 : inscription de 156

Étape 2 : premier tour de manivelle

Étape 3 : inscription de 79

Étape 4 : passage de la manivelle en position haute

La Curta est à présent en mode soustractif.

Étape 5 : second tour de manivelle

Le compteur principal indique la différence des deux termes.

Si l'on effectue une suite d'additions et de soustractions et que l'on souhaite que le compteur de tours indique le nombre de termes, il est nécessaire de placer le levier inverseur en position basse à chaque fois que la manivelle est en positon haute.